北京儿童医院儿童保健中心成立于七十年代，2000年6月1日正式由保健科更名为儿童保健中心。中心拥有一支雄厚的专业队伍、完整的儿童保健服务内容和流畅的检测程序，是一家集挂号、缴费、检测和诊疗于一体的儿童保健机构。
北京儿童医院保健中心
门诊时间：周一至周五8：00-16：00;周六、周日、节假日8：30-11：00。
北京儿童医院技术力量雄厚。拥有重点学科儿科学，国家儿童肿瘤监测中心、国家呼吸系统疾病临床医学研究中心、国家中西医协同旗舰医院试点单位等12个平台，8个国家临床重点专科，5个北京市重点实验室，2个北京市级研究平台以及16个市级医疗中心。医院设有疑难罕见病例会诊中心和远程会诊中心，儿科疑难重症疾病的诊断水平居国内地位，是中华医学会儿科学分会、儿外科分会，中国医师协会小儿外科医师分会，中华护理学会儿科专业委员会主任委员单位。
多年来，为方便患者就医，北京儿童医院始终坚持24小时接诊。医院积极践行公立医院改革，推进预约挂号工作，优化服务流程，改善患者就医体验，受到国家卫生健康委的肯定和广大群众的认可。医院还承担了上级部门委派的重大儿童传染病防治、抗震救灾支援、突发公共卫生事件救治等医疗任务。