医院开诊断证明的流程：１．病人确实存在疾病，医生确诊后才会出具医疗诊断证明。２．医院有规定：各类医疗诊断证明病历上要有记载，不见病人不开病假、不跨科开病假、不开人情病假以及绝不允许开假病假或者疾病诊断证明。
开诊断证明一般先到门诊办公室或医务科联系，说明情况后，挂号看病，经治医生书写诊断证明后，再到门诊办公室或医务科加盖专用章就可以了。但是某些特殊情况下（如交通事故、纠纷等），必须有相关部门的证明。
病诊断证明书一般是具有职业医师资格的医生签字，由院收费处盖章后方能生效，特殊疾病证明书必须由具有执业医师资格的专科医生签字。由医务科盖章后方能生效，同时开诊断书的医生应对所作出的诊断负法律责任，另外诊断证明书的内容都有病历记载。要对身体做详细的检查来诊断。
诊断证明的合法性：诊断证明一般要求县级以上医疗单位出具，有的乡镇等医院出具医疗诊断证明比较随意，因此需要一定核实。如：根据法律、法规规定，必须是伤者就医的医院才能出具诊断证明，必须出具证明的经办人是疗伤者的主治医生，诊断证明必须明确。